Структура
Дирекция ОИЯИ
Непосредственное руководство деятельностью Института осуществляет дирекция, возглавляемая директором Института. В состав дирекции также входят научный руководитель, вице-директора, директора лабораторий, главный ученый секретарь и главный инженер.
Руководящие и консультативные органы
Высшим органом управления Институтом является Комитет полномочных представителей правительств государств – членов Института. Каждое государство – член Института имеет одного представителя в Комитете полномочных представителей.
Лаборатории
Первоначально в ОИЯИ входило две лаборатории: Лаборатория ядерных проблем с действующим синхроциклотроном и Лаборатория высоких энергий с синхрофазотроном. По мере расширения тематики научно-исследовательских работ на текущий момент в структуре ОИЯИ числится 7 лабораторий и Учебно-научный центр.
Общеинститутские подразделения
Кроме научных лабораторий в структуру ОИЯИ также входят научно-организационные службы, административно-хозяйственные и производственные подразделения.