Лаборатория информационных технологий

Дата и время: вторник, 18 мая 2021 г., в 15:00

Место: Онлайн-семинар в Webex, Лаборатория информационных технологий

Информация о семинаре и подключении в Webex

1. Тема доклада: «Разработка информационных систем для теоретических и прикладных задач на базе платформы HybriLIT»

   Докладчик: Бутенко Юрий Александрович

   Аннотация:
   
   В докладе представлен обзор двух разрабатываемых информационных систем (ИС) на базе платформы HybriLIT. Основной целью создания этих ИС является автоматизация проведения расчетов, а также обеспечение хранения и анализа данных для различных групп исследователей.
   Информационная система, предназначенная для проведения радиобиологических исследований, предоставляет инструментарий для хранения экспериментальных данных различных типов, набор программных средств для анализа поведенческих паттернов лабораторных животных и для изучения патоморфологических изменений в центральной нервной системе после воздействия ионизирующего излучения и других факторов. Данная ИС включает в себя блоки по хранению и предоставлению доступа к экспериментальным данным, и блок анализа данных на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения.
   Также на базе платформы HybriLIT ведется разработка виртуальной исследовательской среды (ВИС) для моделирования физических процессов в сложных системах, основанных на джозефсоновских переходах. ВИС сочетает в себе удобные инструменты на базе web-технологий для создания моделей, интерфейса для проведения расчетов на гетерогенной вычислительной платформе HуbriLIT, визуализации результатов расчетов и предоставляет различным исследовательским группам среду для организации совместных исследований, обмена моделями и результатами расчетов.




2. Тема доклада: «Алгоритмы для автоматизации обработки данных экспериментов радиобиологических исследований»

   Докладчик: Стадник Алексей Викторович

   Аннотация:
   
   В работе представлены результаты по разработке алгоритмического блока информационной системы, создаваемой в рамках совместного проекта ЛИТ им. М.Г. Мещерякова и ЛРБ, по автоматизации обработки экпериментальных данных радиобиологических исследований.
   Разработанные алгоритмы анализа данных построены на базе алгоритмов машинного и глубокого обучения и алгоритмов компьютерного зрения. Задачи анализа данных экспериментов включают в себя алгоритмы для анализа видеоматериалов и анализа изображений. В рамках анализа видеоматериалов разработаны алгоритмы автоматизированной разметки экспериментального поля установки, анализ характеристик поведения лабораторного животного в течение времени проведения эксперимента и формирование сводной информации по характеру поведения животных. Для анализа изображений разработаны алгоритмы включающие в себя сегментацию и классификацию нейронов головного мозга лабораторных животных с учетом присутствующих на изображении шумов.
   Представленные алгоритмы реализованы как компоненты информационной системы, предоставляющей возможности для проведения анализа различным исследовательским группам в рамках совместных исследований.